ELIXIR - GR: Η Ελληνική Ερευνητική υποδομή για Διαχείριση και Ανάλυση δεδομένων στις Βιοεπιστήμες

• δημιουργία μιας διαδικτυακής υπηρεσίας (WebService) για την πρόβλεψης θέσης νουκλεοσωμάτων σε γονιδιωματικές αλληλουχίες.
• αναβάθμιση του εργαλείο λογισμικού SymCurv.
• αναβάθμιση του εργαλείου λογισμικού SymCurv με σκοπό την ταχύτερη εφαρμογή του στην πρόβλεψη θέσεων νουκλεοσωμάτων από την πρωτοταγή αλληλουχία γονιδιωματικού DNA.
• μετατροπή της SymCurv από εργαλείο γραμμής εντολών σε διαδικτυακή υπηρεσία που θα επιτρέπει σε απομακρυσμένους χρήστες την διεξαγωγή αναλύσεων σε αλληλουχίες ενδιαφέροντος
• σύνδεση της διαδικτυακής υπηρεσίας με βάσεις δεδομένων γονιδιωματικής ώστε ο χρήστης να μπορεί να εκτελέσει άμεσα υπολογισμούς σε περιοχές δημοσιευμένων γονιδιωμάτων χωρίς την παροχή της αλληλουχίας αλλά με απλό καθορισμό των συντεταγμένων της.
• εκτέλεση του αλγορίθμου SymCurv σε γονιδιωματική κλίμακα και η εφαρμογή του σε πλήρη, δημοσιευμένα γονιδιώματα με σκοπό την εξαγωγή genome-wide χαρτών νουκλεοσωμικής τοποθέτησης

Δεν υπάρχουν δημοσιεύσεις σε περιοδικά ή συνέδρια

Δεν έχουν αναρτηθεί ακόμα αποτελέσματα